Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms