Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ3A6PVS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ3A6PVS8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ3A6PVS8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms