Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms