Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGA8Q9Y5G5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGA8Q9Y5G5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms