Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR55Q9Y2T6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms