Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF6Q9Y252 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF6Q9Y252 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms