Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN11AQ9UI33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN11AQ9UI33 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN11AQ9UI33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms