Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms