Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRAK4Q9NWZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRAK4Q9NWZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRAK4Q9NWZ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRAK4Q9NWZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRAK4Q9NWZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms