Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC17Q9NVM6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC17Q9NVM6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms