Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP85Q9BW27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP85Q9BW27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms