Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM29Q9BSF4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms