Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D3AQ9BRG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms