Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF560Q96MR9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF560Q96MR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms