Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERAC1Q96JX3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms