Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCMH1Q96GD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCMH1Q96GD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCMH1Q96GD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms