Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1E2Q96A05 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms