Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T0

TOP6BL, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP6BLQ8N6T0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP6BLQ8N6T0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP6BLQ8N6T0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms