Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf53Q8N3J3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C17orf53Q8N3J3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms