Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q71RC1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q71RC1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q71RC1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q71RC1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q71RC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q71RC1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q71RC1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q71RC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q71RC1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q71RC1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q71RC1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms