Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRIP3Q6Q6R5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms