Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDB3Q6NSJ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHLDB3Q6NSJ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms