Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLEC12Q5KU26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COLEC12Q5KU26 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms