Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF4Q2M2E3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF4Q2M2E3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms