Protein–RNA interactions for Protein: Q24JQ0

TMEM241, Transmembrane protein 241, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241Q24JQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM241Q24JQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM241Q24JQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM241Q24JQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM241Q24JQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms