Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC18A3Q16572 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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