Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SS18Q15532 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SS18Q15532 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SS18Q15532 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SS18Q15532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SS18Q15532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms