Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SPNS1-208ENST00000566059 1615 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 SPNS1-211ENST00000568829 780 ntTSL 515.41■□□□□ 0.062e-12■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.53□□□□□ -1.364e-11■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 54.58□□□□□ -1.684e-11■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.684e-11■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 29.09□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 47.2
PCBP2Q15366 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 SEPT9-226ENST00000589920 580 ntTSL 214.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 412.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 47.1
PCBP2Q15366 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.133e-11■■■■■ 47
PCBP2Q15366 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.757e-12■■■■■ 47
PCBP2Q15366 APEX2-202ENST00000471758 728 ntTSL 28.77□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.199e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.669e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.769e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 ARID1B-230ENST00000637810 5073 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 216.53■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NMRK1-207ENST00000494066 1903 ntTSL 220.17■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 420.01■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 219.55■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 418.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 415.18■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 47
PCBP2Q15366 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 47
PCBP2Q15366 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-40■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-40■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.336e-11■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.276e-11■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 313.17□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 46.9
PCBP2Q15366 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 318.07■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 BTRC-206ENST00000475200 527 ntTSL 318.44■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 BTRC-201ENST00000370183 655 ntTSL 313.74□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 BTRC-205ENST00000465182 685 ntTSL 36.97□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 PCBP2-211ENST00000547987 681 ntTSL 38.52□□□□□ -1.055e-9■■■■■ 46.8
PCBP2Q15366 CCNY-210ENST00000497692 478 ntTSL 211.01□□□□□ -0.653e-16■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 CCNY-205ENST00000465416 432 ntTSL 58.84□□□□□ -0.993e-16■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 522.98■■□□□ 1.272e-10■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 02e-12■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 46.7
PCBP2Q15366 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 PRKY-201ENST00000472666 288 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 320.52■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 319.81■□□□□ 0.761e-16■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 GRINA-207ENST00000531992 597 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-16■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 312.85□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 418.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 516.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 516.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 415.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 215.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 46.6
PCBP2Q15366 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 46.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 305.4 ms