Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPTAN1Q13813 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTAN1Q13813 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms