Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB3Q12988 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB3Q12988 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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