Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3C1Q12789 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF3C1Q12789 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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