Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YNR065CYNR065C 3351 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 BUD25YER014C-A 462 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 YIL165CYIL165C 360 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 FRS1YLR060W 1788 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 RPL43BYJR094W-A 279 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 YPL162CYPL162C 822 nt6.82□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 GCV1YDR019C 1203 nt6.81□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 CWH43YCR017C 2862 nt6.8□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 YPR109WYPR109W 885 nt6.8□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 KRE29YER038C 1395 nt6.8□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 ARG82YDR173C 1068 nt6.8□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 MCM6YGL201C 3054 nt6.79□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 MRPL3YMR024W 1173 nt6.79□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 YPR059CYPR059C 387 nt6.78□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 RVB1YDR190C 1392 nt6.78□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 RSA4YCR072C 1548 nt6.78□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 EGT2YNL327W 3126 nt6.78□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 KIN2YLR096W 3444 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 GDB1YPR184W 4611 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 YDR161WYDR161W 1164 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 MET16YPR167C 786 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 PHO87YCR037C 2772 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 LAG2YOL025W 1983 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 RRB1YMR131C 1536 nt6.76□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 RMI1YPL024W 726 nt6.75□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 TPK1YJL164C 1194 nt6.74□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 FLC1YPL221W 2382 nt6.74□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 CMK2YOL016C 1344 nt6.74□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 IGO2YHR132W-A 396 nt6.74□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 CNB1YKL190W 528 nt6.74□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 RPS14AYCR031C 414 nt6.73□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 FMP46YKR049C 402 nt6.73□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 FKH2YNL068C 2589 nt6.73□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 YEL077CYEL077C 3834 nt6.73□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 YDR282CYDR282C 1245 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 NCS6YGL211W 1080 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 MIC26YGR235C 702 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 LSO1YJR005C-A 282 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 UGA1YGR019W 1416 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 RPL12AYEL054C 498 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 YJR096WYJR096W 849 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 NTR2YKR022C 969 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 DSS4YPR017C 432 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 ATG22YCL038C 1587 nt6.72□□□□□ -1.33
TY2B-BQ12491 COQ4YDR204W 1008 nt6.71□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 STE20YHL007C 2820 nt6.71□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 EFT2YDR385W 2529 nt6.71□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 EFT1YOR133W 2529 nt6.71□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 CDC12YHR107C 1224 nt6.7□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 SYP1YCR030C 2613 nt6.7□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 RPB7YDR404C 516 nt6.69□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 COX4YGL187C 468 nt6.69□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 YCL012CYCL012C 405 nt6.69□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 ZPR1YGR211W 1461 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 SUR2YDR297W 1050 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 ERG20YJL167W 1059 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 SPO19YPL130W 672 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 MAK3YPR051W 531 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 RMD9YGL107C 1941 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 NMD5YJR132W 3147 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 GCR1YPL075W 2358 nt6.68□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 SSL1YLR005W 1386 nt6.67□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 FUR1YHR128W 651 nt6.67□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 JHD2YJR119C 2187 nt6.67□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 SSY5YJL156C 2100 nt6.67□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 ACS1YAL054C 2142 nt6.67□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 YPL245WYPL245W 1365 nt6.66□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 POP1YNL221C 2628 nt6.66□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 MCM1YMR043W 861 nt6.66□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 YFT2YDR319C 825 nt6.65□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 DPH1YIL103W 1278 nt6.65□□□□□ -1.34
TY2B-BQ12491 PWP1YLR196W 1731 nt6.65□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 MRS2YOR334W 1413 nt6.65□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CAF16YFL028C 870 nt6.64□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 PUS5YLR165C 765 nt6.64□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 YNL194CYNL194C 906 nt6.64□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 RSC58YLR033W 1509 nt6.64□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 RML2YEL050C 1182 nt6.63□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 VHS2YIL135C 1311 nt6.63□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 HXT2YMR011W 1626 nt6.63□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 HES1YOR237W 1305 nt6.62□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 VTC2YFL004W 2487 nt6.62□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 YEL067CYEL067C 588 nt6.62□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CWC25YNL245C 540 nt6.62□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 RAD28YDR030C 1521 nt6.61□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 YMR221CYMR221C 1515 nt6.61□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CWC2YDL209C 1020 nt6.61□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CAB3YKL088W 1716 nt6.6□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 OCA4YCR095C 1089 nt6.6□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 OTU1YFL044C 906 nt6.6□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CDC28YBR160W 897 nt6.6□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 SPC105YGL093W 2754 nt6.6□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 YLR407WYLR407W 687 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 ABZ1YNR033W 2364 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 SWC3YAL011W 1878 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 IMD2YHR216W 1572 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 LTV1YKL143W 1392 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 CSR1YLR380W 1227 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 YML116W-AYML116W-A 303 nt6.59□□□□□ -1.35
TY2B-BQ12491 PDR10YOR328W 4695 nt6.58□□□□□ -1.36
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