Protein–RNA interactions for Protein: Q07988

YLR040C, Cell wall protein YLR040C, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR040CQ07988 NOP13YNL175C 1212 nt5.41□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 snR19snR19 568 nt5.41□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 ALD6YPL061W 1503 nt5.41□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 PKC1YBL105C 3456 nt5.41□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 NOP7YGR103W 1818 nt5.41□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 ICL1YER065C 1674 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 ERC1YHR032W 1746 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 HIR1YBL008W 2523 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 MEK1YOR351C 1494 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 YDR015CYDR015C 240 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 CHO1YER026C 831 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 ACT1YFL039C 1128 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 RPS2YGL123W 765 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 YGL262WYGL262W 528 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 DID4YKL002W 699 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 NTR2YKR022C 969 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 ROT1YMR200W 771 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 PSH1YOL054W 1221 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 YPR177CYPR177C 372 nt5.4□□□□□ -1.54
YLR040CQ07988 SAD1YFR005C 1347 nt5.4□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 STE13YOR219C 2796 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 ATP1YBL099W 1638 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YDL119CYDL119C 924 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 INO2YDR123C 915 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PEX14YGL153W 1026 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RPB4YJL140W 666 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 OSW5YMR148W 447 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SET4YJL105W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YEH1YLL012W 1722 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 DIA3YDL024C 1407 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 LDB17YDL146W 1476 nt5.39□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RAD24YER173W 1980 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PYC1YGL062W 3537 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PAD1YDR538W 729 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PHB1YGR132C 864 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RPC25YKL144C 639 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YKR051WYKR051W 1257 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SEC17YBL050W 879 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RFM1YOR279C 933 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YPL102CYPL102C 303 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 MED8YBR193C 672 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 UBP8YMR223W 1416 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 FKH1YIL131C 1455 nt5.38□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 ARP1YHR129C 1155 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 MRT4YKL009W 711 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 APN1YKL114C 1104 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 IRC25YLR021W 540 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SMD3YLR147C 306 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YLR156WYLR156W 345 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YLR159WYLR159W 345 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YLR161WYLR161W 345 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 COG5YNL051W 1212 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YPR142CYPR142C 564 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 CEG1YGL130W 1380 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 GIP2YER054C 1647 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RAD7YJR052W 1698 nt5.37□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 LAP2YNL045W 2016 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 FLC3YGL139W 2409 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YDL057WYDL057W 987 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 IDP1YDL066W 1287 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YDL218WYDL218W 954 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YIM2YMR151W 438 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YNL143CYNL143C 393 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 TEX1YNL253W 1269 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YNL285WYNL285W 372 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RBA50YDR527W 1320 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 GIT1YCR098C 1557 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 TFG1YGR186W 2208 nt5.36□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 DSF1YEL070W 1509 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YNR073CYNR073C 1509 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 CUS1YMR240C 1311 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 KEG1YFR042W 603 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 VAM7YGL212W 951 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YIL089WYIL089W 618 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 DJP1YIR004W 1299 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SDS22YKL193C 1017 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 GEP5YLR091W 882 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RPS31YLR167W 459 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SPC2YML055W 537 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 LTO1YNL260C 597 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PFA3YNL326C 1011 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 ROX3YBL093C 663 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YPR071WYPR071W 636 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 UTP4YDR324C 2331 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 PRD1YCL057W 2139 nt5.35□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 COQ6YGR255C 1440 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 ALG1YBR110W 1350 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 SRO9YCL037C 1305 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 RNH202YDR279W 1053 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 BMH1YER177W 804 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YFH7YFR007W 1062 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YFR045WYFR045W 930 nt5.34□□□□□ -1.55
YLR040CQ07988 YKL031WYKL031W 414 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1310.4 ms