Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA1Q02410 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APBA1Q02410 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBA1Q02410 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms