Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNB1P98172 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNB1P98172 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNB1P98172 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms