Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2IP78347 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms