Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A2P43004 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms