Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX1P22670 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX1P22670 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX1P22670 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX1P22670 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX1P22670 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX1P22670 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX1P22670 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX1P22670 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX1P22670 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX1P22670 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX1P22670 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX1P22670 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX1P22670 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFX1P22670 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX1P22670 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX1P22670 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX1P22670 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX1P22670 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX1P22670 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms