Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1P21675 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1P21675 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1P21675 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1P21675 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1P21675 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF1P21675 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF1P21675 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF1P21675 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF1P21675 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1P21675 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1P21675 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1P21675 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1P21675 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1P21675 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1P21675 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1P21675 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1P21675 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1P21675 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1P21675 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1P21675 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1P21675 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1P21675 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1P21675 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1P21675 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms