Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN8P19075 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms