Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM1P18669 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms