Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F5P12259 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F5P12259 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F5P12259 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F5P12259 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F5P12259 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F5P12259 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F5P12259 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F5P12259 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F5P12259 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F5P12259 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F5P12259 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F5P12259 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
F5P12259 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F5P12259 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
F5P12259 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F5P12259 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
F5P12259 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
F5P12259 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F5P12259 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F5P12259 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F5P12259 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F5P12259 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F5P12259 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F5P12259 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms