Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA6AP0CW24 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA6AP0CW24 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms