Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYPP08247 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYPP08247 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYPP08247 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYPP08247 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPP08247 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYPP08247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPP08247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPP08247 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPP08247 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPP08247 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPP08247 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPP08247 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPP08247 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPP08247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPP08247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms