Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFPP02771 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFPP02771 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFPP02771 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFPP02771 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFPP02771 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFPP02771 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFPP02771 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFPP02771 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFPP02771 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFPP02771 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFPP02771 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFPP02771 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFPP02771 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFPP02771 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFPP02771 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFPP02771 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFPP02771 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFPP02771 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFPP02771 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFPP02771 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFPP02771 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFPP02771 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFPP02771 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFPP02771 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFPP02771 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFPP02771 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFPP02771 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFPP02771 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFPP02771 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFPP02771 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFPP02771 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFPP02771 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFPP02771 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFPP02771 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFPP02771 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFPP02771 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms