Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM8O95777 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM8O95777 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM8O95777 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM8O95777 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM8O95777 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM8O95777 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM8O95777 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM8O95777 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM8O95777 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM8O95777 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM8O95777 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM8O95777 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM8O95777 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM8O95777 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM8O95777 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM8O95777 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.8 ms