Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3APO60318 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3APO60318 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms