Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASA4O43374 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASA4O43374 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASA4O43374 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASA4O43374 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASA4O43374 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASA4O43374 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RASA4O43374 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms