Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NIZ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NIZ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NIZ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NIZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A6NIZ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NIZ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NIZ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NIZ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms