Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01549A6NIU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01549A6NIU2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms